В 1610, в Смутное время, город Козельск был полностью разграблен и разрушен войсками поляков.

В 1708 году Козельск вошел в состав Смоленской губернии. В петровское время Козельский узед был активным поставщиком леса для кораблестроительных дел Петра.

В 1719 году Козельск вошел в состав Калужской провинции Московской губернии, причем Козельск был более чем в два раза крупнее и населённее Калуги. В 1776 года было сформировано Калужское наместничество, в которое входило 12 уездов, включая Козельский. В 18-19 веках по территории Козельского района проходила транзитная зона торговли.